Необходимыми структурными подразделениями ГБУЗ РМ «Республиканская клиническая больница №5» являются бухгалтерия и экономический отдел.

Эффективная и оперативная работа, четкий учет и контроль материальных ценностей, соблюдение финансовой дисциплины стали возможны благодаря внедрению информационных технологий, объединению в единую локальную сеть структурных подразделений и грамотной работе коллектива под руководством главного бухгалтера Кузнецовой Н.В. и заместителя главного врача по экономическим вопросам Криворотовой Л.М.